Skip to main content

Table 1 Allele frequencies and heterozygosities of SINE insertions in C. nasus populations

From: SINE Retrotransposon variation drives Ecotypic disparity in natural populations of Coilia nasus

Locus

XS

CM

JJ

TH

PY

DT

Total Pop

Het

Æ’SINE

Het

Æ’SINE

Het

Æ’SINE

Het

Æ’SINE

Het

Æ’SINE

Het

Æ’SINE

Æ’SINE

Het

Ls40

0.90

0.20

0.65

0.50

0.50

0.80

0.45

0.30

1.00

0.00

1.00

0.00

0.75

0.30

Ls5

0.60

0.00

0.80

0.00

0.60

0.00

0.50

0.00

0.00

0.00

0.20

0.00

0.45

0.00

Ls58

1.00

0.00

1.00

0.00

1.00

0.00

1.00

0.00

0.10

0.00

0.00

0.00

0.68

0.00

Ls60

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.50

1.00

0.50

1.00

0.17

0.33

Ls29

1.00

0.00

1.00

0.00

1.00

0.00

1.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.67

0.00

Mean

0.70

0.04

0.69

0.01

0.62

0.16

0.59

0.06

0.32

0.20

0.34

0.20

0.54

0.13

  1. Abbreviations: XS Xiangshan; CM Chongming; JJ Jingjiang; TH Taihu Lake; PY Poyang Lake; DT Dongting Lake. The fsine values donate SINE frequency, and Het donates genomic heterozygosity